SomaticSignatures包于2015年发表在bioinformatcis杂志上，该杂志为专业的生物信息学杂志，该包旨在通过对肿瘤的single-nucleotide variants(SNP)数据进行分析，找到肿瘤发生发展，演化机制。本文将介绍如何使用snv数据分析得到该肿瘤的特征snp。

数据准备

数据需要的是SNP数据，其中需要的数据有"Sample",“chr”, “pos”,“ref”, “alt”，分别为样本，染色体，snp起始位置，结束位置，参考ref的碱基，alt的碱基。对于下载到的TCGA的数据，我还是使用python处理好。 原始数据

……

阅读全文